Το σχολείο ιδρύθηκε το 1986 και στεγάστηκε αρχικά στις σχολές του Βιοτεχνικού Επιμελητηρίου Ηρακλείου (σχολές Νιταδώρου) στη Νέα Αλικαρνασσό.
Μέχρι το 1994 λειτουργούσε σε διπλή βάρδια και συστεγαζόταν με το Γενικό Λύκειο Ν. Αλικαρνασσού και το Τεχνικό Λύκειο Ηρακλείου. Το σχολικό έτος 1994-95 μεταφέρθηκε σε δικό του κτίριο στην οδό Λυμπέρη Λυμπερίου 1 ( δίπλα στην Εθνική οδό) όπου λειτουργεί μέχρι σήμερα.
Από την ίδρυσή του το 1986 ως το 2011 διετέλεσαν διευθυντές οι: Καπετανάκη Στέλλα (ΠΕ2), Μπάστας Παναγιώτης (ΠΕ2), Καφφεσάκης Νικόλαος (ΠΕ6), Τζωρμπατζάκης Γεώργιος (ΠΕ4), Χρονάκης Κωνσταντίνος (ΠΕ3) και Σφυράκης Μιχαήλ (ΠΕ19).